تسعى إدارة الكراسي لتحقيق عدد من الاهداف الفرعية من خلال هدفها الأساسي التي أنشأت من أجله وهو :
" تنفيذ المهام الإدارية والمالية والإعلامية والفنية المتعلقة ببرنامج كراسي البحث اللازمة لتحقيق أهدافه " حيث نصت لائحة الكراسي العلمية بالجامعة على أن تتولى إدارة كراسي البحث المهام الإدارية والمالية التالية:
أ -متابعة التقارير المالية والإدارية للكراسي.
ب-إعداد تقارير الأداء للكراسي البحثية.
ج -القيام بكل ما يتصل بالنواحي الإعلامية، وشؤون العلاقات العامة.
د -متابعة ممولي وداعمي الكراسي البحثية.
هـ -إعداد الحساب الختامي لبرامج الكراسي، ورفعه إلى لجنة كراسي البحث العلمي.
و -تنفيذ القرارات الصادرة من لجنة الكراسي.